长江流域极危物种“鳤”高质量染色体水平基因
IT之家 12 月 26 日新闻,九江市农业迷信院于 12 月 24 日宣布博文,发布以第一签名单元结合中山年夜学、江西省瑞昌长江四各人鱼原种场,初次实现并宣布长江流域极危物种“鳤”高品质染色体程度基因组。鳤曾是我国主要的海水经济鱼类,普遍散布于长江流域,但是,因为情况好转跟人类运动的影响,数目急剧降落,在《中国脊椎植物白色名录》跟《中国生物多样性白色名录 — 脊椎植物卷》中均被列为极危(CR),2020 年 12 月在长江公安江段监测到了 7 尾鳤,是比年田野考察发明最多的一次,急切须要对其发展维护。鳤基因组信息的缺少是维护任务的严重阻碍之一,为进一步发掘其种质资本特点,团队成员应用 PacBio 跟 Hi-C 测序数据组装了鳤染色体级其余基因组,巨细为 883.1 Mb,包括 24 条假染色体,Scaffold N50 长度为 35.1 Mb,共同转录组测序数据猜测了 28674 个卵白质编码基因,并已将组装跟解释数据颁布到 GenBank 跟 Figshare 数据库。论文独特通信作者卢开国表现:“鳤基因组信息的初次宣布对懂得遗传多样性、辨认奇特顺应性以及制订无效的维护战略至关主要”。IT之家附上参考地点A chromosome-level genome assembly of critically endangered Ochetobius elongatus长江流域极危物种-鳤高品质染色体程度基因组初次组装实现并宣布
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